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Estructura de la proteína iniciadora de la replicación de un plásmido de resistencia a antibióticos


 

La replicación de ADN es un proceso esencial de los organismos vivos que garantiza la presencia de una copia del material genético en las células hijas. La replicación por círculo rodante (RCR) es un mecanismo sencillo donde un corte en una de las hebras de ADN genera un extremo 3’-OH que sirve como cebador para la ADN polimerasa. La RCR es usada en algunos plásmidos de procariotas, bacteriófagos y virus de ADN. En el artículo publicado en Nucleic Acids Research gracias a la colaboración entre los grupos de Miquel Coll (IBMB-CSIC e IRB Barcelona) y Gloria del Solar (CIB Margarita Salas-CSIC), se analiza el mecanismo de reconocimiento del ADN por la proteína iniciadora de la replicación (RepB) del plásmido pMV158. Se muestra la estructura 3D del dominio de unión al origen (OBD) de RepB unido a las repeticiones directas que constituyen la región bind del origen de replicación. Además, el análisis de la afinidad de unión de mutantes del OBD ha permitido determinar que los residuos localizados en la hélice 2 juegan un papel clave. Por otro lado, se describe una nueva estructura hexamérica de RepB que evidencia la gran flexibilidad que la proteína muestra en la disposición del dominio OBD en relación al dominio de oligomerización (OD). Esta flexibilidad es esencial para que RepB reconozca el locus bind y realice un corte en una de las hebras de ADN dentro del locus nic del origen de replicación. El plásmido pMV158, aislado de Streptococcus agalactiae, contiene un gen de resistencia a tetraciclina y puede transmitirse a otras bacterias patógenas, con el riesgo que esto conlleva. Conocer el mecanismo por el que este plásmido es capaz de replicar en un amplio rango de bacterias puede ayudar en el diseño de fármacos que dirijan su acción a la proteína iniciadora de la replicación. 

 

Machón C, Ruiz Masó JA, Amodio J, Boer DR, Bordanaba Ruiseco L, Bury K, Konieczny I, del Solar G, Coll M. Structures of pMV158 replication initiator RepB with and without DNA reveal a flexible dual function protein. 2023. Nucleic Acids Research. doi: https://doi.org/10.1093/nar/ gkac1271.


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