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Un nuevo mecanismo de funcionamiento enzimático


 

Las modificaciones postraduccionales de las proteínas son de una gran importancia, ya que regulan la actividad biológica de las proteínas, generando así importantes mecanismos de control celular. SUMO es una proteína que tiene la capacidad de modificar post-traduccionalmente otras proteínas a través de una cascada enzimática llamada SUMOilización. De entre las proteínas implicadas en este proceso, destaca la actividad E3 ligasa del complejo Smc5/6, formado por diversas proteínas que participa activamente en la reparación del daño al ADN. Un trabajo realizado por el grupo de David Reverter (IBB-UAB), en colaboración con el grupo de Jordi Torres-Rosell (IRB-Lleida) revela el funcionamiento de la SUMO E3 ligasa del complejo Smc5/6, identificando los puntos clave de la formación del enlace isopeptidico entre SUMO y el substrato proteico. En este trabajo, se presenta la estructura tridimensional de dos proteínas del complejo Smc5/6, Nse2 y Smc5, que interaccionan con dos proteínas de la vía de SUMOilización, la E2 y SUMO. Ello ha permitido definir diversas superficies de unión entre las proteínas que forman el complejo y caracterizar el mecanismo de la acción de esta SUMO E3 ligasa, capaz de posicionar el enlace tioéster de la E2-SUMO para aumentar la eficiencia de formación del enlace isopeptídico en el substrato proteico. La estructura tridimensional del complejo Nse2/Smc5/Ubc9/ SUMO, obtenida mediante cristalografía de proteínas y luz del sincrotrón ALBA, ha permitido observar la presencia y la relevancia de dos moléculas de SUMO que participan activamente en el mecanismo de acción de esta E3 ligasa. Un primer SUMO está unido covalentemente al centro activo de la E2, a través de un enlace tioéster, y un segundo SUMO está unido de manera no covalente al lado opuesto de la E2, participando en la fijación del substrato para favorecen la catálisis. 

 

Varejão, N.*, Lascorz, J.*, Codina-Fabra, J., Bellí, G., Borràs-Gas, H., Torres-Rosell, J., & Reverter, D. (2021). Structural basis for the E3 ligase activity enhancement of yeast Nse2 by SUMO-interacting motifs. Nature Communications, 12(1), 7013. doi.org/10.1038/s41467- 021-27301-9


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